根據(jù)《外商投資法》《外商投資法實(shí)施條例》，外商投資企業(yè)的組織形式、組織機(jī)構(gòu)及其活動準(zhǔn)則適用《公司法》《合伙企業(yè)法》等法律規(guī)定。同時規(guī)定，在五年過渡期內(nèi)，可以繼續(xù)保留原企業(yè)組織形式、組織機(jī)構(gòu)等。由于“雙軌制”立法，“外資三法”與《公司法》《合伙企業(yè)法》在公司治理結(jié)構(gòu)、議事表決機(jī)制等方面。《外商投資法》生效實(shí)施后，要在現(xiàn)行《公司法》《合伙企業(yè)法》體系下對外商投資企業(yè)進(jìn)行登記管理，“雙軌制”將在過渡期內(nèi)逐步終結(jié)。在五年過渡期內(nèi)外商投資企業(yè)登記注冊需要注意幾個重點(diǎn)問題： 
　　一是關(guān)于組織形式。2020年1月1日以前依法設(shè)立的外商投資的公司、外商投資合伙企業(yè)，無須辦理企業(yè)組織形式變更登記；不具有法人資格的中外合作企業(yè)和外資企業(yè)，應(yīng)當(dāng)在2025年1月1日前申請組織形式變更登記。同時，考慮到這些企業(yè)不具有法人資格，這類企業(yè)可以申請改制為合伙制企業(yè)，并按照《合伙企業(yè)法》《合伙企業(yè)登記管理辦法》等法律法規(guī)規(guī)定的設(shè)立條件，向登記機(jī)關(guān)申請變更登記，并依法提交有關(guān)材料。 
　　二是關(guān)于組織機(jī)構(gòu)。應(yīng)秉持了《外商投資法》《外商投資法實(shí)施條例》的立法精神，在過渡期內(nèi)充分尊重企業(yè)意思自治，明確只有與《公司法》強(qiáng)制性規(guī)定不相符的登記（備案）事項(xiàng)，現(xiàn)有外商投資企業(yè)才需要申請辦理變更登記、章程備案或者董事備案等手續(xù)。 
　　三是關(guān)于現(xiàn)有外商投資企業(yè)登記注冊的特殊規(guī)定。對于現(xiàn)有外商投資企業(yè)，在過渡期內(nèi)變更組織形式或組織機(jī)構(gòu)前，企業(yè)根據(jù)變更前的組織形式、組織機(jī)構(gòu)以及議事表決機(jī)制申請變更或注銷登記的，登記機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)予以受理。 
　　四是關(guān)于股權(quán)變更的特殊規(guī)定。如果現(xiàn)有中外合資經(jīng)營企業(yè)、中外合作經(jīng)營企業(yè)的組織形式、組織機(jī)構(gòu)等依法調(diào)整后，在合同有效期內(nèi)申請股東變更登記時，有關(guān)股權(quán)轉(zhuǎn)讓辦法執(zhí)行合同約定條件的，登記機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)予以受理。如全體股東重新約定的，按照其約定。 

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